【一】專書
- 《天道鉤沉:一貫道調查報告》台北,元祐,1983。
- 《中國民間信仰》,教育部『高級中學社會科學叢書』,清華大學人文社會學院主編,幼獅文化公司,1992。
- 《宗教與社會》台北,東大書局,1995年。
- 《天道傳燈:一貫道與現代臺灣社會》台北,誠通出版社,1996年。
- 《慈善、救濟與靈修----道院與世界紅卍字會八十年史》預計1998年底寫完。
- 《一貫真傳(1)----張培成傳》,台北:三揚出版社,1998年。
- 《台灣歷史》(高職教科書),三民書局,1999。
- 《台灣史地》(高職教科書),三民書局,1999。
- 《一貫真傳----基礎傳承》,台北,三揚出版社,1999
【二】委託研究
- 《大陸考古工作概況》,海峽交流基金會委託研究計劃,1992。
- 《大陸陝西省文教狀況調查報告》,行政院大陸委員會委託研究計劃,1993。
【三】編譯
- 《人類學導論》台北,桂冠,1978。
- 《蠻荒的訪客──馬凌諾斯基傳》台北,允晨,1982。
- 《文化形貌的導師──克魯伯》,與黃維憲合譯,台北,允晨,1982。
- 《龍華寶經》(校註)台北,元祐,1985。
- 《人心深處--從人類學的觀點談現代社會中的權力結構與符號》台北,業強,1986。
- 《象徵符號與權力結構》台北,金風,1987。
- 《清代華南邊疆民族圖錄》,中央研究院歷史語言研究所、中央圖書館,1992。
【四】論文
- 〈從文化演進的觀點看中國文化發展過程〉《中國民族學通訊》14:7-13,1973。
- 〈在理教:中國民間三教合一信仰的研究〉台大考古人類學研究所碩士論文,1974。
- 〈在理教簡史〉《思與言》15(1):1-17,1977。
- 〈一貫道的民族學研究〉《中華文化復興月刊》11(6):69-79,1978。
- 〈試論無生老母宗教信仰的一些特質〉《中央研究院史語所集刊》 52(3):529-590,1981。
- 〈近世猓黑族所引發的亂事〉《芮逸夫生生八十祝壽論文集》173-203,李亦園、喬健合編,臺北,食貨,1980。
- 〈從地獄遊記看當前台灣社會問題〉《民間信仰與社會研討會》頁116-136 臺灣省民政廳與東海大學社會學系,116-136,1982。
- 〈清境與吉洋:兩個安置從滇緬邊區撤回義民聚落的調查報告〉《中央研究院歷史語所集刊》53(4):747-794,1982。
- 〈中國地獄罪報觀念的形成〉《台灣省立博物館年刊》26:1-36,1983。
- 〈地獄之說與道德思想的研究〉《漢學研究通訊》3(1):3-5,1984。
- 〈從玉歷寶鈔談中國俗民的宗教道德觀念〉《台灣省立博物館年刊》 27:1-15,1984。
- 〈當前台灣民間信仰的發展趨勢〉《漢學研究》2(1):199-234,1984。
- 〈一貫道所顯示的一些當前台灣宗教文化〉《九州學刊》(Chinese Culture Quarterly)3(1):59-70,1987。
- 〈中國民間秘密宗教研究情形的介紹(一)一貫道〉《漢學研究通訊》 7(1):8-12,1988。
- 〈中國民間秘密宗教研究情形的介紹(二)白蓮教〉《漢學研究通訊》 7(2):61-68,1988。
- 〈十六世紀以來中國民間秘密宗教的基本結構〉謝世忠、孫寶鋼主編《人類學研究:慶祝芮逸夫教授九秩華誕論文集》261-278,1989。
- 〈中國士人的經濟倫理〉《歷史月刊》12:69-78,1989。
- 〈明清家訓所蘊含的成就評價與經濟倫理〉《漢學研究》7(1):195- 214,1989。
- 〈台灣日據初期的瘟疫與迎神〉《高曉梅先生八秩祝壽論文集》台北正中,1990:305-330。
- "Religion and Society in Ch'ing and Japanese Colonial Taipei" Ph.D. dissertation, University of Pennsylvania, 1990 。
- 〈霞海城隍祭典與台北大稻埕商業發展的關係〉《史語所集刊》62(2):291-336,1991年6 月。
- 〈從最近十幾年來的鸞作遊記式善書談中國民間信仰裡的價值觀〉發表於『中國人的價值觀國際研討會』,臺北,漢學研究中心主辦,1991年5月23日至26日。
- 〈試論四十年來臺灣宗教的發展情形〉,第一屆『臺灣經驗』研討會,國立中正大學歷史研究所主辦,民國八十一年四月二十七、二十八日。論文集《臺灣經驗(二)--社會文化篇》,頁175-224,台北,東大圖書公司,1994。
- 〈重利與顯親----有關臺灣經驗各家理論的檢討和歷史文化論的提出〉,第一屆『臺灣經驗』研討會,國立中正大學歷史研究所主辦,民國八十八一年四月二十七、二十八日。論文集《臺灣經驗(一)----歷史經濟篇》頁1-90,台北,東大圖書公司,1993。
- 〈高雄市誌宗教篇〉1992年6月。高雄市文獻會。
- 〈清代臺灣的善書與善堂〉,發表於「民間信仰與中國社會」研討會,民國八十二年四月二十六日至二十八日,漢學研究中心主辦。論文集上冊頁75-95,1994年4月。
- 〈海峽兩岸宗教文化之傳承與發展〉,《海峽兩文化交流之展望》,頁321-363,台北,明文書局,1992。
- 〈試析五本臺灣日據時代的善書〉《台大考古人類學刊》50期,頁127-162,1993年7月交稿,1995年6月刊出。
- 〈清代台灣的宗教與禮俗〉《中央圖書館臺灣分館建館七十八週年、改隸中央二十週年紀念論文集》,頁55-72, 1993。
- 《海峽兩岸四十年》第十三篇〈宗教篇〉,雷飛龍、華力進主編,頁373-423,台北:正中書局,1993年審查通過,1995年5月出版。
- 〈解讀清末在台灣撰作的善書《覺悟選新》〉,《史語所集刊》65(3):673-723,1994。
- 〈神壇的起因:以高雄市神壇為例〉,寺廟與民間文化研討會,1994年3月18日至20日,中國民族學會與漢學研究中心主辦。見《寺廟與民間文化研討會論文集》上冊,頁97-128,1995年3月。
- 〈叛逆與勳爵----先天道在清朝與日據時代台灣不同的際遇〉《歷史月刊》第74期,頁56-64, 1994年3月。
- 〈長城意象在台灣社會之轉變〉「長城國際學術會議」北京,1994年9月23-25日。又發表於國立中央圖書館臺灣分館慶祝建館八十週年論文集,頁447-459,1995年10月。
- 〈蜈蚣閣、藝閣、電子花車:一個歷史的觀察〉《歷史月刊》第82期,頁74-85,1994年11月。
- 〈台灣的善書及其社會文化意義〉,第一屆臺灣本土文化學術研討會,國立臺灣師範大學文學院主辦, 1994年12月10,11日。收於該研討會論文集,頁781-807。1995年4月
- 〈清代澎湖的善書及其社會文化意義〉, 兩岸道教文化研討會, 國立中正大學歷史研究所主辦, 1994年12月10,11日
- 〈關於臺灣善書的研究及其展望〉《新史學》5(4):163-191,1994年12月。
- 〈眾善奉行•諸惡莫作─有關臺灣善書的研究及其展望〉《台北文獻》直字第111期:25-58,1995年3月號。
- 〈過舊曆年?過新曆年?----試論日據時代的曆法改正〉《歷史月刊》85:41-47,1995年2月。
- 〈從正宗書畫社這個例子談「乩」是什麼〉道教、民間信仰與民間文化國際研討會,中央研究院文學哲學研究所主辦,1995年4月28日至29日。收入《儀式、廟會與社區----道教、民間信仰與民間文化論文集》,頁179-196,1996。
- 〈善書在中國社會的意義----以台灣第一本善書『覺悟選新』為例〉中國聖跡與地域材料研究學術討論會,法國,巴黎,法國遠東學術院主辦,1995年5月29日至6月1日。
- 〈西方的宗教預言與末世思想〉《歷史月刊》第92期,1995年7月,頁69-72。
- 〈一貫道在新加坡的傳播以及當地華人的文化認同問題〉發表於「東南亞華人文化的衝突與整合研討會」,馬來西亞中華大會堂聯合會、馬來西亞大學中文系校友會、台灣佛光大學聯合主辦,1997年1月4、5日,馬來西亞吉隆坡。
- 〈二十世紀中國宗教團體的社會慈善事業:以世界紅卍字會為例〉中國經濟史研討會,廈門大學歷史系主辦,1996年6月28日至7月3日,福建武夷山市。
- 〈二十世紀中國社會慈善事業之研究----以煙台卹養院為例〉手稿。
- 〈書房、書院與鸞堂在台灣日據時期的發展〉發表於「第一屆台灣儒學研究國際學術研討會」台南市文廟管理委員會、國立成功大學中文系、國立台南師範學院語文教育系、私立台南家政專科學校主辦,1997年4月11日至13日,台南市。論文集下冊,頁1-76,1997年6月
- 〈以世界紅卍字會為例談民國初年的宗教慈善團體〉,第一屆東亞學術研討會,1997年11月5-6日,佛光大學南華管理學院、日本中央大學、韓國翰林大學聯合主辦。
- 〈二十世紀中國宗教團體的社會慈善事業----以世界紅卍字會為例〉《台大文史哲學報》第45期,頁1-70,1997年6月。
- 〈宗教傳播、商業活動與文化認同----試探一貫道在新馬兩國的發展〉《台大文史哲學報》第46期,1998年6月,印刷中。
- 《台灣近代史文化篇》第三章〈宗教與禮俗〉,頁191-275,台灣省文獻委員會印行1997年6月。
- 〈游彌堅與世界紅卍字會台灣省分會〉《台北文獻》直字第122期,頁189-202,1997年12月。
- 〈書房、書院與鸞堂----試探從清末到現在台灣的宗教變遷〉《國科會研究彙刊:人文及社會科學》第8卷第3期,1998年7月,頁373-395。
- 〈軒轅華胄是天驕--試論民國以來的黃帝信仰與軒轅教〉黃帝及傳統文化研討會,民國八十七年四月七日至八日,太平洋文化基金會與黃帝陵基金會合辦,在陝西西安。《歷史月刊》134期,頁52-60,1999年3月。
- 〈試論新興宗教的起源〉《歷史月刊》第114期,頁79-84,1998年5月。
- 〈士紳、商人與慈善--民國初年一個慈善性宗教團體「世界紅卍字會」〉《輔仁歷史學報》第九卷,頁213-292,1998年6月。
- 〈中國占卜術的起源〉《歷史月刊》第126期,頁28-30,1998年7月。
- 〈科學的宗教----以軒轅教和圓覺宗為例〉,史語所講論會講稿,1998年11月23日。
- 〈從書房到鸞堂----台灣二十世紀上半期本地宗教的變化〉「跨世紀台灣文化發展國際學術研討會」,1998年10月22,23日,國立台灣大學主辦。
- 〈現代科學教育和宗教教育的省思與展望〉「人文與中華文化學術研討會,中華青年交流協會、救國團社會研究院主辦,1998年12月12-13日。
- 〈王鳳儀的性理講病〉,1999年1月9日,「養生、醫療與宗教研討會」,中央研究院歷史語言研究所主辦。
- 〈科學與宗教:關於人類學宗教研究古典理論的檢討和展望〉《台灣大學考古人類學刊》第54期,1999年。(排印中)
- 〈近年來臺灣方志宗教篇的簡評〉,五十年來臺灣方志成果評估與末來發展學術研究會論文集,頁159-176,1999年5月。
- 〈慈善與修行:以世界紅卍字會的「贛賑工作」為例〉,歷史上慈善活動與社會動力國際研討會,1999年12月5-8日香港中文大學新亞書院主辦。
- 〈二十世紀中國與世界宗教互動之回顧與展望〉,「二十世紀的中國與世界」國際學術研討會,2000年1月6-8日,中央研究院近代史研究所主辦。以此為題,在天帝教主辦的「宗教信仰與現代文明」研討會上做主題演講,1999年12月17日。
- 〈從道原經的註釋看先秦道家對信息的瞭解〉,《佛學與科學期刊》創刊號,2000年7月。
- 〈一個移殖的教派:一貫道基礎組在在汐止、南港一帶之發展1950-1999〉,第八屆中國海洋史學術研討會,2000年3月30-31日,中央研究院中山人文社會科學研究所主辦。
- 〈一貫道在台灣的發展及其策略之探討〉,第三屆國際漢學會議,2000年6月29日至7月1日,中央研究院歷史語言研究所主辦。
- 二十世紀台灣的退化性疾病與宗教的勃興Degenerative Diseases and Religious Prosperity in 20th century Taiwan.將發表於Conference ofCultural Dilemmas During Transitions, 2000年10月15-17日, 國科會與波蘭學術院合辦。
- 現代科學教育和宗教教育的省思與展望(手稿)
- 中醫的科學基礎
- 中醫、科學與生命
- 五、六千年前登上宇宙巨網站與I-mail
- 內聖外王
- 從巫覡及及相關的宗教概念探討中國古代出土資料
- 藉由海寧格的「家族星座排列」反思中國文化的一些問題
- 儒家文化與孫文思想
- 台灣民間宗教的基本理論與善書
- 施琅與台灣的媽祖信仰
- 中共查禁民間教派政策之形成
- 從SARS學到了什麼
- 生命學報發刊詞
- 心性、科學、道德經
【五】書評
- 評 David Johnson, Andrew J. Nathan and Evelyn S. Rawski合編 Popular Culture in Late Imperial China. Los Angles: University of California Press, 1985. 刊於《近代中國史研究通訊》6:184-192, 1989。中央研究院近代史研究所出版。
- 評 David K. Jordan與Daniel L. Overmyer合著 The Flying Phoenix: Aspects of Sectarianism in Taiwan. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 1986. 刊於《新史學》 2:155-159, 1990年六月。
- 評賈士蘅《古人類古文化》,臺北,五南,1990。刊於《新史學》4: 161-167,1990年12月。
- 評 Philip Kuhn著 Soulstealers: The Chinese Sorcery Scare of 1768. 刊於《近代史研究訊》第十一期, 1991年3 月。
【六】演講
- 心靈的究竟 社會大學 民國88年11月17日。
- 修練面面觀 台大人類學系 民國88年11月18日。
- 思索中華文化的老根厚植在台灣
【七】新聞論壇
- 莫把中醫當作假想敵
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